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使用installr升级R至最新版本

rpkg 升级R一直是一件比较痛苦的事情,你需要先安装新的R,然后在逐一安装以前装过的包。最快的办法也是把以前的包文件夹拷到新的R中,然后在新的版本中运行包更新。由于官方的源一般都提供最新R版本的二进制文件,所以为了更好的稳定性一般也要跟着升级。所以这是一件相对痛苦又不得不做的事情。

现在installr程序包提供了自动化升级的途径,你只需要回答几个问题就可以将R升级至最新版本,同时相应的程序包也会及时的得到更新。你需要做的只是:

install.packages("installr")
library(installr)
updateR()

然后就会提示最新的R版本,和是否需要拷贝老版本的R程序包目录,是否需要移除老的程序包目录以及是否更新新的版本中的程序包。一切搞定之后会提醒你是否需要打开新的RGui,程序会默认将系统的默认R设置为最新版,因此RStudio也会自动切换到最新的R版本。下面是升级之后RStudio的启动提示

R version 3.1.2 (2014-10-31) -- "Pumpkin Helmet"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.

R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

可以查看一下现在程序包里的库都是对应哪个版本的R编译的(图片见文章开头):

pkgs<-installed.packages()
plot(as.factor(pkgs[,'Built']),col=2:4,main='Packages built version',ylab='Count of packages')

可以看到大部分程序包都更新到了最新的R,但是还有不少还停留在大版本号3.1.0上,也有小部分还是3.1.11。总的来看,R的升级还是很成功的,使用起来也很方面。

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